Svarta partiklar som flyter omkring i vattnet brukar ofta bero på humus som trillat ner i vattentäkten. Humus är helt enkelt nedbrutna växter i naturen. Det är inte farligt att dricka men kan orsaka dålig lukt och smak vilket kan vara otrevligt. Humus i vattnet kan även leda till missfärgning av kläder och andra textilier. Då kan man behöva ett humusfilter.
En annan förklaring kan vara att vattnet innehåller mangan, en naturligt förekommande mineral. Mangan kan vara hälsoskadligt i större mängder och kan leda till skador på nervsystemet hos barn. Enligt Livsmedelsverket är gränsvärdet för mangan i vattnet 0,3 mg/l. Mangan i vattnet åtgärdas enkelt med ett järn- och manganfilter.